Doctorant Adnalyser de la Population d'Arn Axonaux dans le Cerveau de la Drosophile par Transcriptomie Spatiale H/F - INRIA

A propos d'Inria

Inria, l'institut national de recherche dans les sciences et technologies du numérique, est en appui de l'État pour les stratégies nationales de recherche et d'innovation du numérique en tant qu'Agence de programmes. Inria mène plus de 300 projets de recherche et d'innovation avec ses 3500 scientifiques, ingénieurs et personnels d'appui, en partenariat avec les universités et l'écosystème numérique (entreprises, entrepreneurs, acteurs publics). Ensemble, nous explorons des domaines clés comme l'intelligence artificielle, la cybersécurité, l'informatique quantique, le Cloud, la transformation numérique de la santé, les jumeaux numériques ou encore les technologies numériques pour la défense. Nous construisons des solutions concrètes telles que des logiciels, des startups technologiques, des partenariats avec les entreprises du tissu national et des formations de pointe. Notre objectif : l'impact scientifique, technologique et industriel au service de la souveraineté numérique de la France.

Doctorant F/H Adnalyser de la population d'ARN axonaux dans le cerveau de la drosophile par transcriptomie spatiale

Type de contrat : CDD

Niveau de diplôme exigé : Bac +5 ou équivalent

Fonction : Doctorant

Niveau d'expérience souhaité : Jeune diplômé

A propos du centre ou de la direction fonctionnelle

L'Inria est l'Institut national de recherche en sciences du numérique, dont le centre Inria d'Université Côte d'Azur fait partie. Avec une forte expertise en informatique et mathématiques appliquées, les projets de recherche du centre Inria d'Université Côte d'Azur touchent toutes les dimensions des sciences et technologies du numérique, et génèrent de l'innovation. Implanté principalement à Sophia Antipolis, mais également à Nice ou Montpellier, il regroupe 47 équipes de recherche et neuf services d'appui. Il est présent dans les domaines de l'intelligence artificielle, la science des données, la sécurité des systèmes informatiques, la robotique, l'ingénierie de réseaux, la prévention des risques naturels, la transition écologique, la biologie numérique, les neurosciences computationnelles, les données de santé... Le Centre Inria d'Université Côte d'Azur est un acteur majeur en termes d'excellence scientifique par les résultats obtenus et les collaborations tant au niveau européen qu'international.

Contexte et atouts du poste

Dans le cadre d'un partenariatpublic avec ANR.

L' objectif est dedévelopper un algorithme de recalage et d'analyse de données de transcriptomie spatiale
plus particulièrement dédié à l'analyse de population neuronale dans la drosophile.

Mission confiée

Collaboration :
La personne recrutée sera en lien avec une équipe de l'institut de biologie de Valrose et une équipe de l'IPMC.

Responsabilités :
La personne recrutée a la charge du choix de l'algorithme, du développement du logiciel et de sa validation.

Principales activités

Principales activés :

• Proposer des solutions algrotihmique pour le recalage 2D vers 3D
• Développer les logiciels
• Valider les logiciels sur les données fournies par les partenaires de l'IBV et de l'IPMC.
• Rédiger des articles

Compétences

Compétences techniques et niveau requis :

• Niveau M2
• Langage Python.
• Analyse d'image.
• Une appétance pour la biologie est appréciée
• Langues : anglais

Avantages

• Restauration subventionnée
• Transports publics remboursés partiellement
• Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
• Possibilité de télétravail (après 6 mois d'ancienneté) et aménagement du temps de travail
• Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
• Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des oeuvres sociales d'Inria)
• Accès à la formation professionnelle
• Sécurité sociale

Rémunération

Durée: 36 mois
Localisation: Sophia Antipolis, France
Rémunération brute mensuelle : 2300€

• Python
• Anglais
• Analyse de données